Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArxO35085 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ArxO35085 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ArxO35085 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ArxO35085 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ArxO35085 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms