Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sprr3O09116 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sprr3O09116 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sprr3O09116 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sprr3O09116 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sprr3O09116 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr3O09116 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms