Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap23O09044 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap23O09044 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms