Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ltbp2O08999 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ltbp2O08999 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ltbp2O08999 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ltbp2O08999 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ltbp2O08999 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ltbp2O08999 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ltbp2O08999 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ltbp2O08999 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ltbp2O08999 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ltbp2O08999 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ltbp2O08999 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ltbp2O08999 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ltbp2O08999 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ltbp2O08999 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ltbp2O08999 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ltbp2O08999 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ltbp2O08999 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ltbp2O08999 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ltbp2O08999 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ltbp2O08999 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms