Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna5O08543 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms