Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms