Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms