Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm8356J3QPD3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.8 ms