Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240aJ3QNP9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms