Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms