Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf148G3X9R7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf148G3X9R7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf148G3X9R7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf148G3X9R7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf148G3X9R7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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