Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SprtnG3X912 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms