Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Gm28038F7BCN9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Gm28038F7BCN9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Gm28038F7BCN9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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