Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D430041D05RikF6ZGR6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D430041D05RikF6ZGR6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D430041D05RikF6ZGR6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D430041D05RikF6ZGR6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D430041D05RikF6ZGR6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D430041D05RikF6ZGR6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D430041D05RikF6ZGR6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms