Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms