Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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