Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pate1E9Q658 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms