Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms