Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms