Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms