Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gcn1E9PVA8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gcn1E9PVA8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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