Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia4B8QI36 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia4B8QI36 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms