Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms