Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms