Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms