Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prrt4B2RU40 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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