Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slfn8B1ARD8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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