Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms