Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Scn3aA2ASI5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms