Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam43bA2AM80 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms