Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms