Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms