Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Akap17bA2A3V1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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