Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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