Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms