Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Top3bQ9Z321 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms