Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms