Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mbd1Q9Z2E2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mbd1Q9Z2E2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mbd1Q9Z2E2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mbd1Q9Z2E2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mbd1Q9Z2E2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mbd1Q9Z2E2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mbd1Q9Z2E2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mbd1Q9Z2E2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mbd1Q9Z2E2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Mbd1Q9Z2E2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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