Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3Q9Z2D8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms