Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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