Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trpc2Q9R244 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trpc2Q9R244 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trpc2Q9R244 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trpc2Q9R244 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trpc2Q9R244 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpc2Q9R244 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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