Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psma4Q9R1P0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms