Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms