Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms