Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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