Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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AmfrQ9R049 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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AmfrQ9R049 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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AmfrQ9R049 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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AmfrQ9R049 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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AmfrQ9R049 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms