Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms