Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gpc1Q9QZF2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gpc1Q9QZF2 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gpc1Q9QZF2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gpc1Q9QZF2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gpc1Q9QZF2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gpc1Q9QZF2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gpc1Q9QZF2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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