Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc3Q9QZC1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms