Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms